RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517514.1

CLN8-202, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 4

Gene CLN8, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-202ENST00000517514 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-202ENST00000517514 DMDP11532 3685 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-202ENST00000517514 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-202ENST00000517514 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-202ENST00000517514 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 A0A1W2PP55 124 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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CLN8-202ENST00000517514 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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CLN8-202ENST00000517514 NEBLO76041 1014 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 SUN1O94901 812 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 AP2A1O95782 977 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 CPP00450 1065 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-202ENST00000517514 SERPINA4P29622 427 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-202ENST00000517514 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-202ENST00000517514 DUPD1Q68J44 220 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 IPMKQ8NFU5 416 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 EID2BQ96D98 161 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 HINFPQ9BQA5 517 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 APOL2Q9BQE5 337 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 FICDQ9BVA6 458 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-202ENST00000517514 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.95□□□□□ -0.82
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