RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 AFPP02771 609 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HEXAP06865 529 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXC6P09630 235 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 XBP1P17861 261 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 POU1F1P28069 291 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSTR2P30874 369 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FMO4P31512 558 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCKARP32238 428 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ICAM3P32942 547 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MXI1P50539 228 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HDAC4P56524 1084 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 ERV3-1Q14264 604 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 VEPH1Q14D04 833 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP2R5BQ15173 497 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAF11Q15544 211 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MMEL1Q495T6 779 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC35F3Q8IY50 421 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCP11L2Q8N4U5 519 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLEC18CQ8NCF0 446 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR14A16Q8NHC5 309 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM163Q8TC26 289 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYZL4Q96KX0 146 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MARK4Q96L34 752 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CSF3RQ99062 836 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOX4Q9NPH5 578 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1B0GVC2 190 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1B0GVM2 712 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GAGE10A6NGK3 116 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASAP2O43150 1006 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGFB1I1O43294 461 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 VNN2O95498 520 aa2.24□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 ETFAP13804 333 aa2.24□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGS2P41220 211 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAFAH1B1P43034 410 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPD2P43304 727 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 AMTP48728 403 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 VAMP2P63027 116 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZXDBP98169 803 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTP4A2Q12974 167 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLCB4Q15147 1175 aa2.24□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 BAK1Q16611 211 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2orf68Q2NKX9 166 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ALG11Q2TAA5 492 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.24□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
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RNU6-344P-201ENST00000516635 TXNDC8Q6A555 127 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 LCTLQ6UWM7 567 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PGBD5Q8N414 524 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 AADATQ8N5Z0 425 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMRP1Q8NCR6 262 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZMIZ2Q8NF64 920 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL17REQ8NFR9 667 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ELP5Q8TE02 316 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIB2Q92519 343 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 WASF1Q92558 559 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 RND1Q92730 232 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNAPC3Q92966 411 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MED30Q96HR3 178 aa2.24□□□□□ -2.05
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