RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSKH2Q96QS6 385 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZZEF1O43149 2961 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBFA2T2O43439 604 aa16.98■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERAP2Q6P179 960 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.98■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPH1Q92598 858 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEPT3Q9UH03 358 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NENFQ9UMX5 172 aa16.98■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CKMT1AP12532 417 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 JUPP14923 745 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 THOP1P52888 689 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AP1S1P61966 158 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBATAQ96M53 351 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP29Q9HBJ7 922 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.96■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGFALSP35858 605 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCNN1BP51168 640 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAB2P98082 770 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC14Q15048 493 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC18A3Q16572 532 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPOCK2Q92563 424 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTBD6Q96KE9 485 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC7Q99615 494 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLF15Q9UIH9 416 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHD6Q8TD26 2715 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQ67 120 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7ESM1 405 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
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