RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512331.5

RUFY3-210, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene RUFY3, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-210ENST00000512331 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CHODLQ9H9P2 273 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 USP22Q9UPT9 525 aa6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 A0A1B0GTW7 788 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TTC26A0AVF1 554 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CCDC169A6NNP5 214 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 EPHB6O15197 1021 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DHHO43323 396 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TLR2O60603 784 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GH1P01241 217 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 LGALS2P05162 132 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 EDN1P05305 212 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF286BP0CG31 522 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 FGFR4P22455 802 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GLRA2P23416 452 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 RBL1P28749 1068 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SERPINA4P29622 427 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 NTSR1P30989 418 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 NDUFV1P49821 464 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 EPHB4P54760 987 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 NR1H2P55055 460 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 HSD11B2P80365 405 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GTF2BQ00403 316 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SREBF2Q12772 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DRP2Q13474 957 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CSHL1Q14406 222 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 MTF1Q14872 753 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 KCNA10Q16322 511 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CCL14Q16627 93 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 METRNLQ641Q3 311 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 BBS12Q6ZW61 710 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CNGA4Q8IV77 575 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 USP6NLQ92738 828 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GLG1Q92896 1179 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM143Q96AN5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 MIEF2Q96C03 454 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GNRHR2Q96P88 292 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TTPALQ9BTX7 342 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 AZI2Q9H6S1 392 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DMAC2Q9NW81 257 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 NFU1Q9UMS0 254 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DERAQ9Y315 318 aa6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SCN1AP35498 2009 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 DENND3A2RUS2 1198 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 LEFTY2O00292 366 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 LAMTOR5O43504 91 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GPANK1O95872 356 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ADRB2P07550 413 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 MMP3P08254 477 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TPM1P09493 284 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CYP2B6P20813 491 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CD6P30203 668 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ARL2P36404 184 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 KCNC1P48547 511 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 FOXL1Q12952 345 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ACVR2BQ13705 512 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CAPSQ13938 189 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 TOMM20Q15388 145 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SYT13Q7L8C5 426 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 UCMAQ8WVF2 138 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 SLC35C1Q96A29 364 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 CCDC51Q96ER9 411 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 PANX2Q96RD6 677 aa6.84□□□□□ -1.31
RUFY3-210ENST00000512331 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms