RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FTH1P19P0C7X4 201 aa18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 FECHP22830 423 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP12P39900 470 aa18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 GLRX5Q86SX6 157 aa18.84■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPTQ96BT3 561 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF157Q96PX1 679 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 UCKL1Q9NWZ5 548 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK13Q9UKR3 277 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 TPRP12270 2363 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
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