RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.76□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 CDH9Q9ULB4 789 aa5.76□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 PTPRDP23468 1912 aa5.76□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 WDR27A2RRH5 827 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 OR6C75A6NL08 312 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 USP27XA6NNY8 438 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 H7C4K7 107 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 TULP2O00295 520 aa5.75□□□□□ -1.49
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GAPVD1-218ENST00000495588 VNN2O95498 520 aa5.75□□□□□ -1.49
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GAPVD1-218ENST00000495588 SPA17Q15506 151 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 PTPN14Q15678 1187 aa5.75□□□□□ -1.49
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GAPVD1-218ENST00000495588 C2CD6Q53TS8 623 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 NAA35Q5VZE5 725 aa5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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GAPVD1-218ENST00000495588 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.75□□□□□ -1.49
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GAPVD1-218ENST00000495588 KRT83P78385 493 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 ROR1Q01973 937 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 PTP4A2Q12974 167 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 GPR17Q13304 367 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 PDCLQ13371 301 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 CAMK1Q14012 370 aa5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
GAPVD1-218ENST00000495588 RAB30Q15771 203 aa5.74□□□□□ -1.49
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