RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR48Q8TAF3 677 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CNPY3Q9BT09 278 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LHX3Q9UBR4 397 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CREB3O43889 395 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 C1QL1O75973 258 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ANXA6P08133 673 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 HTR7P34969 479 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PEX5P50542 639 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 BLKP51451 505 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TMPRSS3P57727 454 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PPARDQ03181 441 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 FAXCQ5TGI0 409 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MCEEQ96PE7 176 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DPH1Q9BZG8 443 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DONSONQ9NYP3 566 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SATB2Q9UPW6 733 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.79■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPAN11A1L157 253 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MUSKO15146 869 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf61Q13536 156 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 IRF4Q15306 451 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PERM1Q5SV97 790 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 AGPAT1Q99943 283 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CLPBQ9H078 707 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.78■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 INSIG1O15503 277 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TSHRP16473 764 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DESP17661 470 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ITIH2P19823 946 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC14Q15048 493 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CYTH1Q15438 398 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 NETO2Q8NC67 525 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVH48-1M5A8F1 160 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 YY2O15391 372 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PIGNO95427 931 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 UBXN1Q04323 297 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 AGERQ15109 404 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ELOCQ15369 112 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 UGP2Q16851 508 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOC2Q96KP1 924 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC19Q9H756 370 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PDFQ9HBH1 243 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PADI4Q9UM07 663 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ALPIP09923 528 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 HK3P52790 923 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 NDST2P52849 883 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TPI1P60174 286 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SKOR1P84550 965 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MYL5Q02045 173 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.76■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KLK10O43240 276 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF11O60813 436 aa22.75■■□□□ 1.23
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