RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 STEAP4Q687X5 459 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CNTD1Q8N815 330 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM13CQ8NE31 585 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IPMKQ8NFU5 416 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 AGR3Q8TD06 166 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MOCOSQ96EN8 888 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 YME1L1Q96TA2 773 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EBF4Q9BQW3 602 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GFRA2O00451 464 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NPC1O15118 1278 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD5O75356 428 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PMPCBO75439 489 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PAGE1O75459 146 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SOAT2O75908 522 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DDHD2O94830 711 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LATS1O95835 1130 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MX2P20592 715 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 AVPR2P30518 371 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB6P35237 376 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SCAPQ12770 1279 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 POU6F1Q14863 301 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RNF220Q5VTB9 566 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DCLK2Q8N568 766 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ATP2A3Q93084 1043 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SHDQ96IW2 340 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NDNQ99608 321 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RTKNQ9BST9 563 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NMUR1Q9HB89 426 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EMCNQ9ULC0 261 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ATP5HO75947 161 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ALDH1A2O94788 518 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EPN2O95208 641 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IL9P15248 144 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FUT4P22083 530 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NMBRP28336 390 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GP5P40197 560 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OCRLQ01968 901 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 KDSRQ06136 332 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GALNT2Q10471 571 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM171BQ6P995 826 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LCA5Q86VQ0 697 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MIPEPQ99797 713 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQH9 124 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 A6NHS1 94 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GYG2O15488 501 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PLIN3O60664 434 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HMBSP08397 361 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GM2AP17900 193 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PTPN4P29074 926 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SLC11A1P49279 550 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RASSF2P50749 326 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IRF9Q00978 393 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CBX3Q13185 183 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RIPK1Q13546 671 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TDGQ13569 410 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ITGA9Q13797 1035 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PCSK7Q16549 785 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C14orf80Q86SX3 495 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms