RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 MTAPQ13126 283 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SEMA5AQ13591 1074 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TPSAB1Q15661 275 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ANO7Q6IWH7 933 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NEK5Q6P3R8 708 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TTC27Q6P3X3 843 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PDIK1LQ8N165 341 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CNTD1Q8N815 330 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF366Q8N895 744 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ACOX2Q99424 681 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HDAC8Q9BY41 377 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SGK2Q9HBY8 427 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 WHRNQ9P202 907 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 EBF1Q9UH73 591 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FANCGO15287 622 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TSPAN6O43657 245 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM23O75077 832 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PGLSO95336 258 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MLNP12872 115 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF30P17039 623 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CNR2P34972 360 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT1P36639 197 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NPY2RP49146 381 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ARL4CP56559 192 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 FAM193AP78312 1265 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SKOR1P84550 965 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SGCGQ13326 291 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CUL1Q13616 776 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 UGP2Q16851 508 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TEX35Q5T0J7 233 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 IER5LQ5T953 404 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.82□□□□□ -0.84
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CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZS52 159 aa9.82□□□□□ -0.84
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CTPS1-210ENST00000486889 CCNJLQ8IV13 435 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PGBD5Q8N414 524 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
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CTPS1-210ENST00000486889 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CDH19Q9H159 772 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 KCNH6Q9H252 994 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PREBQ9HCU5 417 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CHKBQ9Y259 395 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PKP3Q9Y446 797 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 COL4A3Q01955 1670 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1W2PQF6 199 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HEATR9A2RTY3 570 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 H0Y858 1186 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 AXIN1O15169 862 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PFDN6O15212 129 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MID1O15344 667 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 RAD51CO43502 376 aa9.81□□□□□ -0.84
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