RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485275.2

LRIF1-202, Transcript of ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene LRIF1, Length 1,796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1-202ENST00000485275 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.66□□□□□ -0.06
LRIF1-202ENST00000485275 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.66□□□□□ -0.06
LRIF1-202ENST00000485275 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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LRIF1-202ENST00000485275 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.66□□□□□ -0.06
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LRIF1-202ENST00000485275 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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LRIF1-202ENST00000485275 CASC4Q6P4E1 433 aa14.65□□□□□ -0.06
LRIF1-202ENST00000485275 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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LRIF1-202ENST00000485275 NNMTP40261 264 aa14.63□□□□□ -0.07
LRIF1-202ENST00000485275 WASP42768 502 aa14.63□□□□□ -0.07
LRIF1-202ENST00000485275 PTPRCAPQ14761 206 aa14.63□□□□□ -0.07
LRIF1-202ENST00000485275 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.63□□□□□ -0.07
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LRIF1-202ENST00000485275 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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