RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 LRRC53A6NM62 1247 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 INSIG1O15503 277 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TEX33O43247 280 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 USP12O75317 370 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ITIH2P19823 946 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ITPKBP27987 946 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 GABREP78334 506 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 C1orf61Q13536 156 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ACAP1Q15027 740 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 UGP2Q16851 508 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 RBFAQ8N0V3 343 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TBATAQ96M53 351 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LGMNQ99538 433 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LRRC19Q9H756 370 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 J3KR12 359 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF11O60813 436 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SERPINA4P29622 427 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PEX5P50542 639 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 IRF4Q15306 451 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ELOCQ15369 112 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NAT6Q93015 286 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TRIM11Q96F44 468 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SCINQ9Y6U3 715 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 DFFAO00273 331 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MUSKO15146 869 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MPOP05164 745 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ALPIP09923 528 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 GZMAP12544 262 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.33■□□□□ 0.85
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ACTB-212ENST00000484841 RFX8Q6ZV50 586 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SRLQ86TD4 932 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 HID1Q8IV36 788 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF653Q96CK0 615 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CRELD1Q96HD1 420 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZWILCHQ9H900 591 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PDFQ9HBH1 243 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CACNA1GO43497 2377 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LMO7DNF2Z398 122 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SERPINC1P01008 464 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 C6P13671 934 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CSNK1DP48730 415 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LIG3P49916 1009 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BCL2L1Q07817 233 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ISXQ2M1V0 245 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BROXQ5VW32 411 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 WDR48Q8TAF3 677 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 VOPP1Q96AW1 172 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LRRC61Q9BV99 259 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BOCQ9BWV1 1114 aa20.32■□□□□ 0.84
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