RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 SETD9Q8NE22 299 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 TM2D2Q9BX73 214 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 USP44Q9H0E7 712 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 ARL15Q9NXU5 204 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 UPB1Q9UBR1 384 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 FBXO40Q9UH90 709 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGAP1-210ENST00000480054 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A1W2PQM1 296 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PER2O15055 1255 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 TNFSF14O43557 240 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C1QL1O75973 258 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PLAUP00749 431 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 CLEC3BP05452 202 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 URODP06132 367 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 LDHCP07864 332 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 COX7A2P14406 83 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ZBTB16Q05516 673 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PRKG2Q13237 762 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 KRT32Q14532 448 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC22A25Q6T423 547 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 MON1AQ86VX9 555 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 NME8Q8N427 588 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PIGKQ92643 395 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 10.4
RABGAP1-210ENST00000480054 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 MPP6Q9NZW5 540 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 OR6C68A6NDL8 312 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 STRNO43815 780 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ZBED4O75132 1171 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RNF8O76064 485 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SCGB1D1O95968 90 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 LCKP06239 509 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 TFEBP19484 476 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 POLD2P49005 469 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC12A2P55011 1212 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 UFM1P61960 85 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 TFF2Q03403 129 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ERV3-1Q14264 604 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C5orf22Q49AR2 442 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 HAUS3Q68CZ6 603 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C17orf99Q6UX52 265 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RNF144BQ7Z419 303 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SCAIQ8N9R8 606 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SARDHQ9UL12 918 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RTL9Q8NET4 1388 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SNED1Q8TER0 1413 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 SMIM22K7EJ46 135 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 K7ENM7 598 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 CYR61O00622 381 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 INPPL1O15357 1258 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 BBOX1O75936 387 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 CD63P08962 238 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 FCGR2AP12318 317 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ALDH1B1P30837 517 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 BLKP51451 505 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 COL10A1Q03692 680 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 MTA1Q13330 715 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 GRAPQ13588 217 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RPE65Q16518 533 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGAP1-210ENST00000480054 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms