RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 FZD2Q14332 565 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 PROX2Q3B8N5 592 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC49Q8IUZ0 686 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 CALN1Q9BXU9 219 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa23.65■■□□□ 1.38
C9orf3-215ENST00000478473 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MUSKO15146 869 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MAFKO60675 156 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MFAP3LO75121 409 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PIAS2O75928 621 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM253P0C7T8 217 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 NME1P15531 152 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MAN1A1P33908 653 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SERPINB6P35237 376 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ACADVLP49748 655 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 AP1S1P61966 158 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 YPEL5P62699 121 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SARM1Q6SZW1 724 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ZSWIM9Q86XI8 627 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 OR4C6Q8NH72 309 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 FREM2Q5SZK8 3169 aa23.64■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CSF2P04141 144 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ITIH2P19823 946 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SERPINA4P29622 427 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.376e-13■■■□□ 15
C9orf3-215ENST00000478473 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PARGQ86W56 976 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CAMK1DQ8IU85 385 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CXorf40AQ8TE69 158 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MMP20O60882 483 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MTA2O94776 668 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CKMT2P17540 419 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ACP1P24666 158 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 IGFALSP35858 605 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MMP12P39900 470 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CDH6P55285 790 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC73Q5JTD7 316 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 FAF2Q96CS3 445 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TBATAQ96M53 351 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CHP1Q99653 195 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 MGME1Q9BQP7 344 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF670Q9BS34 389 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.62■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 A0A1W2PQ67 120 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM38O00635 465 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ZZEF1O43149 2961 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SDC3O75056 442 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TPM1P09493 284 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 BCL2L1Q07817 233 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 DPYSL3Q14195 570 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PDK2Q15119 407 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TCEAL1Q15170 157 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TPRG1LQ5T0D9 272 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TMPRSS12Q86WS5 348 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TEX26Q8N6G2 289 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 RNF214Q8ND24 703 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 FATE1Q969F0 183 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 KNTC1P50748 2209 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SCAMP1O15126 338 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SIGLEC6O43699 453 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 SOCS5O75159 536 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 RFPL3O75679 317 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 KRT7P08729 469 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CD48P09326 243 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 PEX5P50542 639 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC3Q13217 504 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CAMK2BQ13554 666 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 ERAP2Q6P179 960 aa23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-215ENST00000478473 CNGA4Q8IV77 575 aa23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms