RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 GPBP1Q86WP2 473 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 ERO1BQ86YB8 467 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 PDSS2Q86YH6 399 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 MIB1Q86YT6 1006 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 CNTROBQ8N137 903 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PQ72 361 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 LCHNA4D1U4 455 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 OR6C74A6NCV1 312 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 ESCO2Q56NI9 601 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 HES5Q5TA89 166 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 FSIP1Q8NA03 581 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.04□□□□□ -1.44
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ECHDC1-215ENST00000475319 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 SHC3Q92529 594 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 LPPQ93052 612 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 PHF21AQ96BD5 680 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 MSANTD3Q96H12 275 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 RIT2Q99578 217 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-215ENST00000475319 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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