RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 TIMP2P16035 220 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNCP24863 283 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 UGP2Q16851 508 aa14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PQ67 120 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 RFX6Q8HWS3 928 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 HDAC11Q96DB2 347 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 TEX26Q8N6G2 289 aa14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 DTLQ9NZJ0 730 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 PJA2O43164 708 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 MMP20O60882 483 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
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SH3BP1-205ENST00000466097 MMP12P39900 470 aa14.86□□□□□ -0.03
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