RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465848.1

DEGS1-204, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

TSL 2

Gene DEGS1, Length 633 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-204ENST00000465848 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 LAS2Q8IYD9 372 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SCAIQ8N9R8 606 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PTP4A1Q93096 173 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 FKBP10Q96AY3 582 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 GPR78Q96P69 363 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 PLK3Q9H4B4 646 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SETD4Q9NVD3 440 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ARL15Q9NXU5 204 aa3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 AMACRQ9UHK6 382 aa3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 TUBE1Q9UJT0 475 aa3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.64□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 AOX1Q06278 1338 aa3.64□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 USP17L23D6RBM5 183 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 EXOC3O60645 756 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 AVILO75366 819 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TADA2AO75478 443 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SLC25A12O75746 678 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 NKX2-2O95096 273 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ONECUT2O95948 504 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 ERCC2P18074 760 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TYK2P29597 1187 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 HPDP32754 393 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 SLC12A2P55011 1212 aa3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 IL11RAQ14626 422 aa3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.63□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 FUT8Q9BYC5 575 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 NUF2Q9BZD4 464 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ASAH2Q9NR71 780 aa3.63□□□□□ -1.83
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