RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.87■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 K7ENP7 123 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 TNFSF15O95150 251 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 SOX5P35711 763 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 RHOAP61586 193 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 SPIDRQ14159 915 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 LY6DQ14210 128 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 WDR59Q6PJI9 974 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 GULP1Q9UBP9 304 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 J3QKU1 62 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 EPHB2P29323 1055 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 LRRC14Q15048 493 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 CYTH1Q15438 398 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 ALG11Q2TAA5 492 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 HID1Q8IV36 788 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 VPS16Q9H269 839 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 LHX3Q9UBR4 397 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.85■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 RASA4BC9J798 803 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 RASA4O43374 803 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 GPD1P21695 349 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 BLKP51451 505 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 SUOXP51687 545 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 ELOCQ15369 112 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 ARL10Q8N8L6 244 aa22.84■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 KYQ8NBH2 561 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 ELP6Q0PNE2 266 aa22.83■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.83■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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USP4-208ENST00000464168 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.83■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.83■■□□□ 1.25
USP4-208ENST00000464168 TSPAN11A1L157 253 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 WASH4PA8MWX3 477 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 ALPIP09923 528 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 C6P13671 934 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 CTSEP14091 401 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 INPP5AQ14642 412 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP4-208ENST00000464168 KRT31Q15323 416 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 UGP2Q16851 508 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 PARP15Q460N3 678 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 EFHC2Q5JST6 749 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 C3orf20Q8ND61 904 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 APOOQ9BUR5 198 aa22.82■■□□□ 1.24
USP4-208ENST00000464168 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.82■■□□□ 1.24
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