RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FPGTO14772 594 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAFKO60675 156 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TM7SF2O76062 418 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PEX11BO96011 259 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINA4P29622 427 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABIFP47224 123 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCNN1BP51168 640 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RENBPP51606 427 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUOXP51687 545 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELP6Q0PNE2 266 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPYSL3Q14195 570 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UGP2Q16851 508 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC157Q569K6 752 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GATA6Q92908 595 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSKH2Q96QS6 385 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM5Q9C035 493 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.71■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CACNA1BQ00975 2339 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM221BA6H8Z2 402 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENC1O14682 589 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MFSD11O43934 449 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKCGP05129 697 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAN1A1P33908 653 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGFALSP35858 605 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PFN3P60673 137 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCL2L1Q07817 233 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FZD2Q14332 565 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF235Q14590 738 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MESDQ14696 234 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ST3GAL2Q16842 350 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCTD6Q8NC69 237 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPTQ96BT3 561 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIAS2O75928 621 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT37O76014 449 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PROS1P07225 676 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C6P13671 934 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DGKAP23743 735 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMP12P39900 470 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP1S1P61966 158 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMG2Q02383 582 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC3Q13217 504 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERAP2Q6P179 960 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A45Q8N413 288 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGBD5Q8N414 524 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAF1Q8N7H5 531 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT43Q96FT9 208 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF670Q9BS34 389 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM38O00635 465 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT7P08729 469 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CR2P20023 1033 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIG3P49916 1009 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDK2Q15119 407 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRF4Q15306 451 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARGQ86W56 976 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BBS5Q8N3I7 341 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TC2NQ8N9U0 490 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RFFLQ8WZ73 363 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MGME1Q9BQP7 344 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BAHCC1Q9P281 2608 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRBP23467 1997 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms