RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF614Q8N883 585 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 STARD8Q92502 1023 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CIB1Q99828 191 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SDCBP2Q9H190 292 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYL12BO14950 172 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 COL6A2P12110 1019 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C4BPBP20851 252 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GRM5P41594 1212 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MAXP61244 160 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP6V0D1P61421 351 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IRF8Q02556 426 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TEX44Q53QW1 395 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM63Q969Q1 353 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OMA1Q96E52 524 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SERAC1Q96JX3 654 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DUSP16Q9BY84 665 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CIPCQ9C0C6 399 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TMCO1Q9UM00 188 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 NRCAMQ92823 1304 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CLDN5O00501 218 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FFAR3O14843 346 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR42O15529 346 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYL12AP19105 171 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IL12RB1P42701 662 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZFP42Q96MM3 310 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RAB26Q9ULW5 256 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TCEA3O75764 348 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 URODP06132 367 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PIRTP0C851 137 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TTPAP49638 278 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF549Q6P9A3 640 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.25□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A0J9YYE9 177 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CENPXA8MT69 81 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SERHLQ9NQF3 203 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IGSF6O95976 241 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CENPAP49450 140 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ITGA1P56199 1179 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DGKZQ13574 1117 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 POC5Q8NA72 575 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LPGAT1Q92604 370 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 NACC2Q96BF6 587 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ASB8Q9H765 288 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GLOD4Q9HC38 313 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ACSS2Q9NR19 701 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SPACA6W5XKT8 324 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC22A3O75751 556 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 JAK1P23458 1154 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PEX2P28328 305 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HPCAL1P37235 193 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AIF1P55008 147 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RALGDSQ12967 914 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C10orf82Q8WW14 230 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms