RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF786Q8N393 782 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM38O00635 465 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KDM1AO60341 852 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DGKIO75912 1065 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ASB9Q96DX5 294 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf50Q9BV19 199 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 HSPA4LO95757 839 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MX2P20592 715 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FGFR3P22607 806 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEA6P43360 314 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GSSP48637 474 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GATMP50440 423 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PRAMEP78395 509 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RAB39AQ14964 217 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MTX3Q5HYI7 312 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NPNTQ6UXI9 565 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MCUQ8NE86 351 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CIB1Q99828 191 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SEPT3Q9UH03 358 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TSC2P49815 1807 aa16.98■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 H7C0C1 242 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 AKAP10O43572 662 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 APRTP07741 180 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ATP5OP48047 213 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LILRA4P59901 499 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RHDQ02161 417 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 HERC3Q15034 1050 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KCNJ8Q15842 424 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFA5Q16718 116 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 UPP1Q16831 310 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CYS1Q717R9 158 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ACDQ96AP0 544 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NME7Q9Y5B8 376 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TADA2AO75478 443 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DDHD2O94830 711 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PTPN2P17706 415 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 OXA1LQ15070 435 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CASD1Q96PB1 797 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TWNKQ96RR1 684 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PSD2Q9BQI7 771 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.97■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KPNA7A9QM74 516 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEA3P43357 314 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PCYT1AP49585 367 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TAF6P49848 677 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DSC1Q08554 894 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NFATC3Q12968 1075 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TUSC3Q13454 348 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TOP1MTQ969P6 601 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF560Q96MR9 790 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CTRCQ99895 268 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CALN1Q9BXU9 219 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.96■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.96■□□□□ 0.3
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms