RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.31■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 AK5Q9Y6K8 562 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 LRCH4O75427 683 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 GCATO75600 419 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 SUOXP51687 545 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 PTK2BQ14289 1009 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 IRF4Q15306 451 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 UGP2Q16851 508 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.3■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 TPP1O14773 563 aa20.29■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 NR1I3Q14994 352 aa20.29■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 FIGNQ5HY92 759 aa20.28■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 IL12RB2Q99665 862 aa20.27■□□□□ 0.84
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HLA-B-250ENST00000434333 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 SCINQ9Y6U3 715 aa20.27■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ATRXP46100 2492 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 LMO7DNF2Z398 122 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 DAPK3O43293 454 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 TSHRP16473 764 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 TGM2P21980 687 aa20.26■□□□□ 0.83
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