RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ACP6Q9NPH0 428 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC182A6NF36 153 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RECQL4O94761 1208 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCR2P25025 360 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 IL12AP29459 219 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SHMT1P34896 483 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF549Q6P9A3 640 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF410Q86VK4 478 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RCN3Q96D15 328 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF446Q9NWS9 450 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MX80 341 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM22K7EJ46 135 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FFAR3O14843 346 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR42O15529 346 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 IDH3BO43837 385 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MGRN1O60291 552 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CBFA2T3O75081 653 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MTA2O94776 668 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DQA2P01906 255 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHA3P29320 983 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 AAGABQ6PD74 315 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG14Q6ZNE5 492 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PROSER1Q86XN7 944 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 S100ZQ8WXG8 99 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 COG5Q9UP83 839 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CABYRO75952 493 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA6P08185 405 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TTPAP49638 278 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR107Q5VW38 600 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 DUPD1Q68J44 220 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SHC3Q92529 594 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A7Q96T83 725 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GAD1Q99259 594 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 OMDQ99983 421 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ETAA1Q9NY74 926 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 XPR1Q9UBH6 696 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA2BP08514 1039 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 DOK6Q6PKX4 331 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ALLCQ8N6M5 410 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 DOCK2Q92608 1830 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TISP43B9A030 160 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX28O15482 410 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SSNA1O43805 119 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CST1P01037 141 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGAVP06756 1048 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK9P45984 424 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A3P55017 1021 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF13Q15543 124 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms