RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 APOL1O14791 398 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PSTPIP1O43586 416 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SH3BP5O60239 455 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MX2P20592 715 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNCP24863 283 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MARCKSL1P49006 195 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 AP1S1P61966 158 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NPNTQ6UXI9 565 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM145Q8NBT3 493 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHDC7BQ96G42 594 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TSGA13Q96PP4 275 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH12Q9NPG4 1184 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNA1AO00555 2505 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPAN11A1L157 253 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF487B1APH4 448 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MATN3O15232 486 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD51BO15315 384 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NXPH1P58417 271 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC14A1Q13336 389 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PIP4P1Q86T03 277 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX26Q8N6G2 289 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 LGMNQ99538 433 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MGME1Q9BQP7 344 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC32A1Q9H598 525 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 GDF3Q9NR23 364 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0U1RQJ8 604 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PJA2O43164 708 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT10P13645 584 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CR2P20023 1033 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM193AP78312 1265 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KAZNQ674X7 775 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 VSIG1Q86XK7 387 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT35Q92764 455 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL3Q9Y4R7 772 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 NEBLO76041 1014 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF883P0CG24 379 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 THEGLP0DJG4 465 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNB1P14635 433 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKN2BP42772 138 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SUOXP51687 545 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ELP6Q0PNE2 266 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ERAP2Q6P179 960 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GCNT7Q6ZNI0 430 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 IQCHQ86VS3 1027 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 MAML1Q92585 1016 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA3CQ99985 751 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 COQ6Q9Y2Z9 468 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 POM121BA6NF01 834 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 A8MX80 341 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEC1O60732 1142 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TM7SF2O76062 418 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CEACAM1P13688 526 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CCT8P50990 548 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GSDMDP57764 484 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 OVGP1Q12889 678 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 NAXDQ8IW45 347 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 OR13H1Q8NG92 308 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.19■■□□□ 1.62
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