RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 STK32AQ8WU08 396 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 BSNDQ8WZ55 320 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFRSF25Q93038 417 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SPACA7Q96KW9 195 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 DUSP16Q9BY84 665 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NPHS2Q9NP85 383 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF24Q9UPV7 400 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CHKBQ9Y259 395 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A087X0B3 334 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 HEATR9A2RTY3 570 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 G3V2T6 193 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 KATNA1O75449 491 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PROSCO94903 275 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF4P15884 667 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF23P17027 643 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ITIH2P19823 946 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 F8A1P23610 371 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP2F1P24903 491 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 XRCC4Q13426 336 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 LPIN1Q14693 890 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ACAP1Q15027 740 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SWI5Q1ZZU3 235 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CBWD6Q4V339 395 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MPPE1Q53F39 396 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf74Q86VG3 221 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM192Q8IY95 271 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB12Q8WXK4 309 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PROX1Q92786 737 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FAR2Q96K12 515 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 BDH2Q9BUT1 245 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CASS4Q9NQ75 786 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIN2DO15399 1336 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A087X0T9 212 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PPC1 479 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CLDN5O00501 218 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PER2O15055 1255 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.76e-7■■■□□ 19
ANKRD28-202ENST00000412318 GYPCP04921 128 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 POLBP06746 335 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNA5P22460 613 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 HTR1BP28222 390 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPZA2P47755 286 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9A3P48764 834 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAM17P78536 824 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKCQQ04759 706 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ENPEPQ07075 957 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 STX4Q12846 297 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ACOX1Q15067 660 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ARSHQ5FYA8 562 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC73Q6P1J9 531 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MTSS1LQ765P7 747 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SZRD1Q7Z422 152 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NAT16Q8N8M0 369 aa4.44□□□□□ -1.7
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