RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 STON2Q8WXE9 905 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 KIFC1Q9BW19 673 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CITO14578 2027 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM221A6NGB7 291 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 HMOX2P30519 316 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SCNN1AP37088 669 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 RAB39AQ14964 217 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 HSFY1Q96LI6 401 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SLC25A23Q9BV35 468 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SELENONQ9NZV5 590 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 J3QRK9 145 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 UGT1A1P22309 533 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 UGT1A4P22310 534 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 MYF6P23409 242 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ARNTP27540 789 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 UGT1A3P35503 534 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 UGT1A5P35504 534 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SLC1A2P43004 574 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 WNT8BQ93098 351 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 NT5C3BQ969T7 300 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 FBXL8Q96CD0 374 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ARMC1Q9NVT9 282 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 NME4O00746 187 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 DAB1O75553 588 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CYP2C9P11712 490 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 OXTRP30559 389 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 GRM5P41594 1212 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 C21orf59P57076 290 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 RELAQ04206 551 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ATP1A4Q13733 1029 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 NEDD8Q15843 81 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CRYBG2Q8N1P7 616 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TANKQ92844 425 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 KLRG1Q96E93 195 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 TEKT5Q96M29 485 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 C3orf30Q96M34 536 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SNX25Q9H3E2 840 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CDH7Q9ULB5 785 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 A8MT66 165 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CBFA2T3O75081 653 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PPIL2Q13356 520 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 DCDC5Q6ZRR9 648 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 FAM35AQ86V20 835 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 IPMKQ8NFU5 416 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 IGSF5Q9NSI5 407 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED8-201ENST00000408953 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms