RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SPAG6O75602 509 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ERVK-10P10266 1014 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PRKCHP24723 683 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 STX2P32856 288 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PCID2Q5JVF3 399 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CPA6Q8N4T0 437 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CYTH2Q99418 400 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CCDC77Q9BR77 488 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 KCTD3Q9Y597 815 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ALDH1A2O94788 518 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 NDST3O95803 873 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC8A1P32418 973 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SULT2A1Q06520 285 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PPM1NQ8N819 430 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 RMDN1Q96DB5 314 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 NAT9Q9BTE0 207 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 VPS18Q9P253 973 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AP3B1O00203 1094 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AURKAO14965 403 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 USP1O94782 785 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 EPOP01588 193 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 HLA-DPA1P20036 260 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CES1P23141 567 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PTPRCAPQ14761 206 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TMED2Q15363 201 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CCNJLQ8IV13 435 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CHST14Q8NCH0 376 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PGM2Q96G03 612 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ARL5AQ9Y689 179 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MYO10Q9HD67 2058 aa20.3■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FAM159BA6NKW6 160 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ANHXE9PGG2 379 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CCL22O00626 93 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 IGSF6O95976 241 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FGF1P05230 155 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 IVLP07476 585 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GSTA2P09210 222 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AP1S1P61966 158 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC14A2Q15849 920 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AAK1Q2M2I8 961 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FRS2Q8WU20 508 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 F5P12259 2224 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MAGEB16A2A368 324 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CDH16O75309 829 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CERS2Q96G23 380 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GUCD1Q96NT3 240 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AGAP2Q99490 1192 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PSAT1Q9Y617 370 aa20.29■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MBTPS2O43462 519 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 LDB2O43679 373 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FZD6O60353 706 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ADRA1DP25100 572 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ARNTP27540 789 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 NR1H3Q13133 447 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CNGA3Q16281 694 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MYLK3Q32MK0 819 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MTSS1LQ765P7 747 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms