RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 RGMBQ6NW40 437 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CDK20Q8IZL9 346 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SPARTQ8N0X7 666 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 OR7G2Q8NG99 324 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TPD52L3Q96J77 140 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 GGA3Q9NZ52 723 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 VPS51Q9UID3 782 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 DISP2A7MBM2 1401 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 A0A096LPK6 155 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 A0A1W2PPW3 197 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 KMOO15229 486 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 BBOX1O75936 387 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TGDSO95455 350 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CYP3A5P20815 502 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SULT2A1Q06520 285 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PRKG2Q13237 762 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 COTL1Q14019 142 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TGFBIQ15582 683 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ASIC4Q96FT7 647 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC17Q96LX7 622 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 FOPNLQ96NB1 174 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 BIRC8Q96P09 236 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PPA2Q9H2U2 334 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SETD4Q9NVD3 440 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 AURKAO14965 403 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 GMDSO60547 372 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SERPINA3P01011 423 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TFPTP0C1Z6 253 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 RARBP10826 455 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 STK11Q15831 433 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 MEA1Q16626 185 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 METTL4Q8N3J2 472 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 OR2T3Q8NH03 318 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 BBS4Q96RK4 519 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CHIAQ9BZP6 476 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 MAFFQ9ULX9 164 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.03□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 OIP5O43482 229 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PRH1P02810 166 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 C8BP07358 591 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 HTR2AP28223 471 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CD40LGP29965 261 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 MATKP42679 507 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 VEGFBP49765 207 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 SLC7A2P52569 658 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 GRTP1Q5TC63 336 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 C16orf46Q6P387 395 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TRABD2AQ86V40 505 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 METTL6Q8TCB7 284 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 WWOXQ9NZC7 414 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 IFT52Q9Y366 437 aa8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
VWA3A-202ENST00000389398 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.8 ms