RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 TSPYL1Q9H0U9 437 aa29.85■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A17Q9H1V8 727 aa29.85■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 FAM153AQ9UHL3 310 aa29.85■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 PMPCBO75439 489 aa29.84■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 FDFT1P37268 417 aa29.84■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD8P48556 350 aa29.84■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 TRAF2Q12933 501 aa29.84■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 POM121L1PQ3SYA9 428 aa29.84■■■□□ 2.37
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ECHS1-201ENST00000368547 VPS45Q9NRW7 570 aa29.84■■■□□ 2.37
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ECHS1-201ENST00000368547 MAP2K7O14733 419 aa29.83■■■□□ 2.37
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ECHS1-201ENST00000368547 HHIPQ96QV1 700 aa29.83■■■□□ 2.37
ECHS1-201ENST00000368547 FOXP3Q9BZS1 431 aa29.83■■■□□ 2.37
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ECHS1-201ENST00000368547 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 METAP1P53582 386 aa29.82■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 CASP8Q14790 479 aa29.82■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC14A2Q15849 920 aa29.82■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 WNT3AP56704 352 aa29.81■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 MRGPRX2Q96LB1 330 aa29.81■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6BA6NDN3 693 aa29.8■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 FAM86C2PA6NEL3 165 aa29.8■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 MID1O15344 667 aa29.8■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6DP0CG33 693 aa29.8■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa29.8■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1A2O94788 518 aa29.79■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 PDHA1P08559 390 aa29.79■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 CEP128Q6ZU80 1094 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 TMC3Q7Z5M5 1100 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ARRDC3Q96B67 414 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ECHDC3Q96DC8 303 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R16AQ96I34 528 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 FSD1LQ9BXM9 530 aa29.79■■■□□ 2.36
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