RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 FGF1P05230 155 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 NMBRP28336 390 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 KRT71Q3SY84 523 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC11Q6PKC3 985 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ZNF778Q96MU6 729 aa17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC8A1P32418 973 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GRIA2P42262 883 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CSNK1DP48730 415 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GALK1P51570 392 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ZNF234Q14588 700 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 RALGPS1Q5JS13 557 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PCID2Q5JVF3 399 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 IER5LQ5T953 404 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EMC10Q5UCC4 262 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MFSD3Q96ES6 412 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 P2RY13Q9BPV8 354 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 HEBP1Q9NRV9 189 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SOX13Q9UN79 622 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC8A2Q9UPR5 921 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TCAF1Q9Y4C2 921 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SPO11Q9Y5K1 396 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 A0A0U1RQS6 177 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 BUD23O43709 281 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 TSHRP16473 764 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CTPS1P17812 591 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CA4P22748 312 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SERPINA4P29622 427 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CTHP32929 405 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 MAPK8P45983 427 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EPHB1P54762 984 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SEC13P55735 322 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 STEAP4Q687X5 459 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ACOX2Q99424 681 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 HCN2Q9UL51 889 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 KCTD3Q9Y597 815 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.91■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 COL4A2P08572 1712 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 WASH3PC4AMC7 463 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 H3BQF6 201 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PGLSO95336 258 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EPOP01588 193 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 UGT2B4P06133 528 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 POLBP06746 335 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 WASP42768 502 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 QPCTQ16769 361 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 POM121L1PQ3SYA9 428 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PKN3Q6P5Z2 889 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ZSWIM9Q86XI8 627 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 UCMAQ8WVF2 138 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 VOPP1Q96AW1 172 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ADGRE3Q9BY15 652 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ACSS3Q9H6R3 686 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
LTV1-201ENST00000367576 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CCL22O00626 93 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RASGRF2O14827 1237 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TIMM44O43615 452 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SPAG6O75602 509 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PRKCHP24723 683 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 STX2P32856 288 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ABL2P42684 1182 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 STAT4Q14765 748 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PON2Q15165 354 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CTAGE3PQ8IX95 158 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PTPRN2Q92932 1015 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ARL8AQ96BM9 186 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 NAT9Q9BTE0 207 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KIFC1Q9BW19 673 aa17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms