RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 EML1O00423 815 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PRKYO43930 277 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 OTCP00480 354 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 THRBP10828 461 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TAF6P49848 677 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NFYCQ13952 458 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 GULP1Q9UBP9 304 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 MND1Q9BWT6 205 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 DACT2Q5SW24 774 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T3Q8NH03 318 aa4.94□□□□□ -1.62
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