RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SCML1Q9UN30 329 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X0T9 212 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE15A4D2H0 777 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ABLIM1O14639 778 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 WNT9AO14904 365 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMCC1O94876 653 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM228BP0C875 321 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE8P0CG41 777 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GOT1P17174 413 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KRT15P19012 456 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A1P43005 524 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A9P82251 487 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 MEA1Q16626 185 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CFAP157Q5JU67 520 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 NAT6Q93015 286 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NLNQ9BYT8 704 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK6Q9Y257 313 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SPACA6W5XKT8 324 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MGAMO43451 1857 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQ67 120 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM149AA5PLN7 773 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB5O43674 189 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 GPNMBQ14956 572 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLMAPQ14BN4 828 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PARP15Q460N3 678 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IER5LQ5T953 404 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HGSNATQ68CP4 663 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SRLQ86TD4 932 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM139Q8IV31 216 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LMO3Q8TAP4 145 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ELMO1Q92556 727 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 WDR92Q96MX6 357 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 THSD1Q9NS62 852 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 HOXC8P31273 242 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ENPEPQ07075 957 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F3Q08477 520 aa4.47□□□□□ -1.69
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