RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1C1P21283 382 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TACR2P21452 398 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KELP23276 732 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 L1CAMP32004 1257 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF148Q8N7C7 305 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DLG3Q92796 817 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BANF1O75531 89 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH1O95259 989 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NFATC1O95644 943 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF3P15923 654 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IL5RAQ01344 420 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC34A1Q06495 639 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LIPMQ5VYY2 423 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PCED1BQ96HM7 432 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SQLEQ14534 574 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CD248Q9HCU0 757 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RPTORQ8N122 1335 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 E9PAM4 449 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DNTTP04053 509 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNGR2P38484 337 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRB2P47870 512 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GBE1Q04446 702 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX6Q13608 980 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM237Q96Q45 408 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMOQ9BU70 441 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BRD9Q9H8M2 597 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX11AO75192 247 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG7O95352 703 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD9Q8NE22 299 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TPD52L3Q96J77 140 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NDST3O95803 873 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CDKN2BP42772 138 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CPA6Q8N4T0 437 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TERB1Q8NA31 727 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CHKBQ9Y259 395 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GVM2 712 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 URADA6NGE7 173 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD11O43934 449 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSL4O60488 711 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 STK32CQ86UX6 486 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DPP10Q8N608 796 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC28A1O00337 649 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNCP24863 283 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP12Q6UXS9 341 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PWWP2AQ96N64 755 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PLK2Q9NYY3 685 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AVILO75366 819 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE5AO76074 875 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3R1P27986 724 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX6P35712 828 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CNSTQ6PJW8 725 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNL1Q8IU54 200 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LINGO1Q96FE5 620 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms