RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 NPWQ8N729 165 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ABCG4Q9H172 646 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 USP29Q9HBJ7 922 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 DKK3Q9UBP4 350 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TSPAN11A1L157 253 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 MUSKO15146 869 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PRAMEF11O60813 436 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 MBD3O95983 291 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TNFAIP3P21580 790 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ACTN2P35609 894 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 MMP12P39900 470 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ASIC2Q16515 512 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PERM1Q5SV97 790 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SLC35F3Q8IY50 421 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 FGF11Q92914 225 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 IL12RB2Q99665 862 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CLPBQ9H078 707 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 EVA1BQ9NVM1 165 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SPASTQ9UBP0 616 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC172P0C7W6 258 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TSHRP16473 764 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 DESP17661 470 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 NDST2P52849 883 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ELP6Q0PNE2 266 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PTK2BQ14289 1009 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 NR0B2Q15466 257 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CFAP58Q5T655 872 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 FAXCQ5TGI0 409 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 KCTD16Q68DU8 428 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 RFX8Q6ZV50 586 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 KYQ8NBH2 561 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LGMNQ99538 433 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 BOCQ9BWV1 1114 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PRORYQ9H606 182 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PARVAQ9NVD7 372 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 OR1A2Q9Y585 309 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LMO7DNF2Z398 122 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 DFFAO00273 331 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PRB1P04280 392 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PCCBP05166 539 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 HTR7P34969 479 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LIG3P49916 1009 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 YPEL5P62699 121 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TLE3Q04726 772 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC14Q15048 493 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 UGP2Q16851 508 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ALG11Q2TAA5 492 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 HID1Q8IV36 788 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF653Q96CK0 615 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 PDXPQ96GD0 296 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SP110Q9HB58 689 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 MYO6Q9UM54 1294 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms