RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 VPS39Q96JC1 886 aa19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PIDD1Q9HB75 910 aa19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SNX15Q9NRS6 342 aa19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 RAI2Q9Y5P3 530 aa19.32■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 K7ERQ8 282 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PRLP01236 227 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PRKCGP05129 697 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CEBPBP17676 345 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GABRB3P28472 473 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MAGEA12P43365 314 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SERPINB8P50452 374 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ZNF77Q15935 545 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG6Q3KR16 790 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 NCEH1Q6PIU2 408 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CMC1Q7Z7K0 106 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 RMDN1Q96DB5 314 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PBX4Q9BYU1 374 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 RHOJQ9H4E5 214 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 DCDC2Q9UHG0 476 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GGT7Q9UJ14 662 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 KCTD3Q9Y597 815 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TRANK1O15050 2925 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CEP290O15078 2479 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PDHA1P08559 390 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PIRTP0C851 137 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SLC1A2P43004 574 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PLK1P53350 603 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PPM1JQ5JR12 505 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ZNF470Q6ECI4 717 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PEX13Q92968 403 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PITPNM3Q9BZ71 974 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 LINC00597Q9H2U6 94 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D14Q9P2M4 693 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ARL5AQ9Y689 179 aa19.31■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PENKP01210 267 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 HADHAP40939 763 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 NRIP1P48552 1158 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SERPINB4P48594 390 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MPP1Q00013 466 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SLC12A1Q13621 1099 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GRM3Q14832 879 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 RALGPS1Q5JS13 557 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 FAM47EQ6ZV65 393 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ARMC2Q8NEN0 867 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ITFG1Q8TB96 612 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CALML6Q8TD86 181 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 IRF7Q92985 503 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 HDAC10Q969S8 669 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 LMLNQ96KR4 655 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GPR22Q99680 433 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ADGRE3Q9BY15 652 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CAB39LQ9H9S4 337 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ABCB8Q9NUT2 735 aa19.3■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A4O43246 635 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SNX3O60493 162 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 GLRA3O75311 464 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 HLA-FP30511 346 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ARSDP51689 593 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 USP4Q13107 963 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 DUSP6Q16828 381 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TMC5Q6UXY8 1006 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 BBS2Q9BXC9 721 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 FBXO5Q9UKT4 447 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CRTAMO95727 393 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MPOP05164 745 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TCF3P15923 654 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEP78395 509 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 ACVR1Q04771 509 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SLC20A2Q08357 652 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 TRAF2Q12933 501 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 INSCQ1MX18 579 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0408Q6ZU52 694 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 MICALCLQ6ZW33 695 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 SRLQ86TD4 932 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 CCDC197Q8NCU1 140 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 LPCAT1Q8NF37 534 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 OR6P1Q8NGX9 317 aa19.29■□□□□ 0.68
UPP1-201ENST00000331803 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms