RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ELP6Q0PNE2 266 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CCNG2Q16589 344 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC12Q5T9G4 340 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF567Q8N184 647 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 WDR24Q96S15 920 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 GMEB2Q9UKD1 530 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DNPEPQ9ULA0 475 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RAI2Q9Y5P3 530 aa26.99■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CTAGE9A4FU28 777 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 MEI4A8MW99 385 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 UPK3BL1B0FP48 263 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 UPK3BL2E5RIL1 263 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 LIASO43766 372 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RETP07949 1114 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CD86P42081 329 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PTGER3P43115 390 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SLC14A2Q15849 920 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PHOX2BQ99453 314 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PHTF1Q9UMS5 762 aa26.98■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NEMP1O14524 444 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FSBPO95073 299 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH8O95206 1070 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 EPN2O95208 641 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TRAF2Q12933 501 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ERAP2Q6P179 960 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM69Q86WT6 500 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DNASE2BQ8WZ79 361 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 BIRC7Q96CA5 298 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa26.97■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PRR23AA6NEV1 266 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C5orf60A6NFR6 353 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf142B7Z368 130 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 AREL1O15033 823 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PGLSO95336 258 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 MMP2P08253 660 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CD68P34810 354 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT1P36639 197 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ABL2P42684 1182 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SKOR1P84550 965 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ARMCX6Q7L4S7 300 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RGL4Q8IZJ4 473 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ACTRT1Q8TDG2 376 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ATG4AQ8WYN0 398 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FCRL5Q96RD9 977 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM121Q9BTD3 319 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 FZD6O60353 706 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CPP00450 1065 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ETF1P62495 437 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RPS21P63220 83 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 CREB5Q02930 508 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM9Q86XI8 627 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 SYT12Q8IV01 421 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 COG1Q8WTW3 980 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TADA1Q96BN2 335 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH12Q9NPG4 1184 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 VPS45Q9NRW7 570 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PPIL1Q9Y3C6 166 aa26.95■■□□□ 1.91
CRIP1-201ENST00000330233 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 LATO43561 262 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 OPHN1O60890 802 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 IGHV4-34P06331 123 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 NFKB1P19838 968 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 ITPKAP23677 461 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 HOXD12P35452 270 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 IHHQ14623 411 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 OASLQ15646 514 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM52BQ4KMG9 183 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 RABEPKQ7Z6M1 372 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 HORMAD1Q86X24 394 aa26.94■■□□□ 1.9
CRIP1-201ENST00000330233 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms