RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
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SPHK1-201ENST00000323374 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TMC7Q7Z402 723 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 HDAC10Q969S8 669 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 NDNQ99608 321 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM17Q9Y577 477 aa21.89■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
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SPHK1-201ENST00000323374 FGF1P05230 155 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 MPSTP25325 297 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 FSCBQ5H9T9 825 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.89■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.89■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 GJB3O75712 270 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 TM7SF2O76062 418 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 PIGNO95427 931 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 IL31Q6EBC2 164 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 PLD4Q96BZ4 506 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 MOCOSQ96EN8 888 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 IGSF21Q96ID5 467 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 FAM161BQ96MY7 647 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB118Q96PH6 123 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 H0Y3Z8 333 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 HDAC3O15379 428 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 COCHO43405 550 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 NUMBP49757 651 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 ARSDP51689 593 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 DENND1CQ8IV53 801 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 MAPK15Q8TD08 544 aa21.88■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 PEX13Q92968 403 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 CMTM5Q96DZ9 223 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 OLFM1Q99784 485 aa21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.88■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 CSHL1Q14406 222 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.091e-7■■■□□ 15.5
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SPHK1-201ENST00000323374 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 THTPAQ9BU02 230 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 CWH43Q9H720 699 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT3Q9UH03 358 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 MCM8Q9UJA3 840 aa21.87■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 KCTD3Q9Y597 815 aa21.87■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 SEC24AO95486 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 ACVR1Q04771 509 aa21.86■■□□□ 1.09
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SPHK1-201ENST00000323374 E9PBE3 544 aa21.86■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 H3BNC9 293 aa21.86■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 CCL22O00626 93 aa21.86■■□□□ 1.09
SPHK1-201ENST00000323374 NPHS1O60500 1241 aa21.86■■□□□ 1.09
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