RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR9A2RTY3 570 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 ALADP13716 330 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DPA1P20036 260 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 LSP1P33241 339 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 SCNN1BP51168 640 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 SGSHP51688 502 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK18Q07002 472 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.775e-7■■■■□ 20.5
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP6Q16828 381 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 RALGPS1Q5JS13 557 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 GRTP1Q5TC63 336 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 CES3Q6UWW8 571 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 TADA1Q96BN2 335 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 CERS2Q96G23 380 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 SGSM3Q96HU1 749 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE1Q99829 537 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 MGME1Q9BQP7 344 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 PBX4Q9BYU1 374 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-201ENST00000319942 GMNCA6NCL1 334 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 INSIG1O15503 277 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MOSPD3O75425 235 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PIAS1O75925 651 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QAP02745 245 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF3P15923 654 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CA4P22748 312 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 COL8A1P27658 744 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GPC1P35052 558 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NRIP1P48552 1158 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CCT5P48643 541 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 IL9RQ01113 521 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 POU6F1Q14863 301 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CYTH1Q15438 398 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC1A5Q15758 541 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FSCBQ5H9T9 825 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PGBD5Q8N414 524 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD3Q96ES6 412 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FEM1CQ96JP0 617 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RANBP9Q96S59 729 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 EPN3Q9H201 632 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF9Q9HAQ2 790 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPM1 405 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMPSTE24O75844 475 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM155BO75949 473 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZWINTO95229 277 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NDST3O95803 873 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF1P05230 155 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP2P08253 660 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-10P10266 1014 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CREB1P16220 341 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 WEE1P30291 646 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GP5P40197 560 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HADHAP40939 763 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CSKP41240 450 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK8P45983 427 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PLK1P53350 603 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOAP61586 193 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NTHL1P78549 312 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE1BQ01064 536 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT2A1Q06520 285 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 UGP2Q16851 508 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A9Q2M3M2 681 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HHATQ5VTY9 493 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms