RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 PTPRRQ15256 657 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 HIF1AQ16665 826 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNV2Q8TDN2 545 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 IL36AQ9UHA7 158 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 NCOR1O75376 2440 aa16■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TSPAN11A1L157 253 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 DLL1O00548 723 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PPFIA2O75334 1257 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 NDST3O95803 873 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MLNP12872 115 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SERPINA4P29622 427 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CRADDP78560 199 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXO43Q4G163 708 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ARSIQ5FYB1 569 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SPOCK2Q92563 424 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SYBUQ9NX95 663 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TTC28Q96AY4 2481 aa15.99■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ALOX15BO15296 676 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 EPOP01588 193 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 FGF1P05230 155 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TPH1P17752 444 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 HLA-DPA1P20036 260 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MGAT1P26572 445 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 COPAP53621 1224 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ARL4CP56559 192 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ZXDAP98168 799 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CDH17Q12864 832 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 GAS6Q14393 721 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 QPCTQ16769 361 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 BBS9Q3SYG4 887 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 LINC00523Q86TU6 105 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC25Q86WR0 208 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ARRDC3Q96B67 414 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 IFT43Q96FT9 208 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SPINT1O43278 529 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CPP00450 1065 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TUBBP07437 444 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PIRTP0C851 137 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 HOXB2P14652 356 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MCM3P25205 808 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 SUN2Q9UH99 717 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 TECTAO75443 2155 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 A0A0U1RQS6 177 aa15.97■□□□□ 0.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC151A5D8V7 595 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms