RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266679.8

CPSF6-201, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPSF6, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6-201ENST00000266679 SNX32Q86XE0 403 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 HPS6Q86YV9 775 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RNF135Q8IUD6 432 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 FAM136AQ96C01 138 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 SLC39A13Q96H72 371 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CATSPER2Q96P56 530 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RTKNQ9BST9 563 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 POMKQ9H5K3 350 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RGS18Q9NS28 235 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CDYLQ9Y232 598 aa13.01□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 A0A087X1B8 175 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 NEMP2A6NFY4 417 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TMEM233B4DJY2 109 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CCL22O00626 93 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 INPPL1O15357 1258 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 UPP2O95045 317 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TBX18O95935 607 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PAX7P23759 505 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 NUDT2P50583 147 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ARPP19P56211 112 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 BTKQ06187 659 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 DSC1Q08554 894 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 SLC10A7Q0GE19 358 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CSHL1Q14406 222 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 METTL21CQ5VZV1 264 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TMEM198Q66K66 360 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IRGCQ6NXR0 463 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TMEM154Q6P9G4 183 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RNF180Q86T96 592 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MIB1Q86YT6 1006 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 OLFM1Q99784 485 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PHF24Q9UPV7 400 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 VCANP13611 3396 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 HEATR9A2RTY3 570 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 AIM2O14862 343 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CKBP12277 381 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RHOQP17081 205 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TFEBP19484 476 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ETFBP38117 255 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 RENBPP51606 427 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 HK2P52789 917 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MARC1Q5VT66 337 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TDHQ8IZJ6 230 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 FBXW8Q8N3Y1 598 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ATAD1Q8NBU5 361 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IGSF8Q969P0 613 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PSMG2Q969U7 264 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 B3GALT6Q96L58 329 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 C1orf74Q96LT6 269 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 FBXO44Q9H4M3 255 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IGSF5Q9NSI5 407 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 A6NHS1 94 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TADA2AO75478 443 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 OAZ2O95190 189 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MMP2P08253 660 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 SLC2A3P11169 496 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 DNAJB1P25685 340 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 BMP8BP34820 402 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 NDST2P52849 883 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 POU4F1Q01851 419 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 TLE2Q04725 743 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ASPHQ12797 758 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 IHHQ14623 411 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MBTPS1Q14703 1052 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CTXN3Q4LDR2 81 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 AAGABQ6PD74 315 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 FBXO32Q969P5 355 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 C8orf48Q96LL4 319 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 ECSITQ9BQ95 431 aa12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CPSF6-201ENST00000266679 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms