RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 KRT4P19013 534 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DRD1P21728 446 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GCAP28676 217 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXN2P32314 431 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GJA4P35212 333 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL4AP40617 200 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH1A3P47895 512 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX6P59796 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB16Q05516 673 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC18A2Q05940 514 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK18Q07002 472 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4F3Q08477 520 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 PLD1Q13393 1074 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ11Q14654 390 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZVU0 165 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM110Q86TL2 294 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf74Q86VG3 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF3Q86WH2 238 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC6Q86X45 466 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC1Q8N766 993 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UBA3Q8TBC4 463 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 APOPT1Q96IL0 206 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TNIP3Q96KP6 325 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM237Q96Q45 408 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NAT9Q9BTE0 207 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TASP1Q9H6P5 420 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 MYLKQ15746 1914 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM149AA5PLN7 773 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MXQ7 604 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINT1O43278 529 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HUS1O60921 280 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GCATO75600 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM155BO75949 473 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MLNP12872 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP3A5P20815 502 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPKBP27987 946 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SSTR1P30872 391 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ELK3P41970 407 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCG1P45844 678 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARFIP2P53365 341 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDO1Q16878 200 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SV2CQ496J9 727 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO43Q4G163 708 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYS1Q717R9 158 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 STRADAQ7RTN6 431 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FITM2Q8N6M3 262 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PLD5Q8N7P1 536 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BANPQ8N9N5 519 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 STKLD1Q8NE28 680 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CXorf38Q8TB03 319 aa7.15□□□□□ -1.26
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