RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 NFASCO94856 1347 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 NR5A2O00482 541 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 NDUFS2O75306 463 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 ATP6V1B2P21281 511 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 GLDCP23378 1020 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 PRKCHP24723 683 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 ARNTP27540 789 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 HTR2BP41595 481 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 CASP3P42574 277 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 POU5F1BQ06416 359 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 SNX17Q15036 470 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 KIZQ2M2Z5 673 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF773Q6PK81 442 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 MCFD2Q8NI22 146 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 CACNA1SQ13698 1873 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRA-201ENST00000216877 KRT87PA6NCN2 255 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 CYP3A7P24462 503 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 BIRC7Q96CA5 298 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 IDI2Q9BXS1 227 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 RAD54BQ9Y620 910 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TSPAN4O14817 238 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 GSRP00390 522 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 MMP8P22894 467 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 HLCSP50747 726 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 CYP24A1Q07973 514 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 IPPQ9Y573 584 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 GNGT2O14610 69 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 PRPSAP2O60256 369 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 IL18RAPO95256 599 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 HMGCRP04035 888 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TSPAN8P19075 237 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 WEE1P30291 646 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 GALNT2Q10471 571 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 GRM1Q13255 1194 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TFDP2Q14188 446 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ARHGEF6Q15052 776 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 NXNL1Q96CM4 212 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 H0YJX3 145 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 GCATO75600 419 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 MEP1AQ16819 746 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 REP15Q6BDI9 236 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 FAR1Q8WVX9 515 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TBATAQ96M53 351 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 UBDO15205 165 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 METTL18O95568 372 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SPNP16150 400 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 HTR1BP28222 390 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SREBF1P36956 1147 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 NCS1P62166 190 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC38Q5VT99 294 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 OR8H2Q8N162 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 RUBCNLQ9H714 662 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TBX20Q9UMR3 447 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 USP18Q9UMW8 372 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 LDLRP01130 860 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 PLK1P53350 603 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 OR2B6P58173 313 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SLC36A3Q495N2 470 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 RORBQ92753 470 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 TRIM15Q9C019 465 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRA-201ENST00000216877 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms