RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.7□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.7□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 SCGB1D2O95969 90 aa14.69□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 CNSTQ6PJW8 725 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 CD101Q93033 1021 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 ALG5Q9Y673 324 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 L7N2F9 121 aa14.68□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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