RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IVLP07476 585 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDK18Q07002 472 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HHATQ5VTY9 493 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TTC25Q96NG3 672 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ITM2BQ9Y287 266 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GMNCA6NCL1 334 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TTC34A8MYJ7 566 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEC16AO15027 2179 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EFCAB14O75071 495 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN11O75508 207 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SERPINF2P08697 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDH4P55283 916 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEP78395 509 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SMARCB1Q12824 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MCUQ8NE86 351 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TSGA13Q96PP4 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FNIP2Q9P278 1114 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GALPQ9UBC7 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 COPEO14579 308 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MPP3Q13368 585 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 BEND5Q7L4P6 421 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM135Q86UB9 458 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LZTR1Q8N653 840 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PDFQ9HBH1 243 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CLDND1Q9NY35 253 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.351e-6■■■□□ 17.2
CNIH1-201ENST00000216416 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TYROBPO43914 113 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN7O95471 211 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R39P59534 338 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SKOR1P84550 965 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CREB5Q02930 508 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FUT11Q495W5 492 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 AFMIDQ63HM1 303 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FGF14Q92915 247 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 VPS39Q96JC1 886 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NPHS2Q9NP85 383 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LTBP2Q14767 1821 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRRT4C9JH25 899 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C2P06681 752 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CD1EP15812 388 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PGAM1P18669 254 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NDST2P52849 883 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IL10RBQ08334 325 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SNX31Q8N9S9 440 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.62□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NXPE3Q969Y0 559 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms