RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr798Q7TRH8 311 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Catsper3Q80W99 395 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CinpQ9D0V8 212 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnq2Q9Z351 759 aa22.75■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930558K02RikE0CXC6 182 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Erich2E9Q1A6 463 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2w1E9Q816 493 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zbtb10E9Q8X5 861 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dnmt3bO88509 859 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CcnfP51944 777 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Crtc1Q68ED7 630 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rtl3Q6P1Y1 553 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sh3d19Q91X43 789 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smim11aQ99J19 55 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Upk1aQ9D132 257 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gprc5dQ9JIL6 344 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 2610028H24RikG5E8K1 270 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r5K7N788 911 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gnao1P18872 354 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gdf7P43029 461 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sipa1P46062 1037 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec4fP70194 548 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd163Q2VLH6 1121 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 OsgepQ8BWU5 335 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc39cQ8VE09 580 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Echdc3Q9D7J9 300 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Maged2Q9ER67 616 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Homer2Q9QWW1 354 aa22.74■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm8257E9Q8R3 264 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prf1P10820 554 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il6raP22272 460 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LynP25911 512 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmx2P43687 273 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc11a2P49282 568 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psme3P61290 254 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Treml2Q2LA85 329 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spryd7Q3TFQ1 196 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hspa1aQ61696 641 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PtprrQ62132 656 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr792Q7TRH9 311 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem220Q8BP07 167 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slco2b1Q8BXB6 683 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stx12Q9ER00 274 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chek2Q9Z265 546 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm6351K9J7D1 481 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chrm1P12657 460 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2a12P56593 492 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pld2P97813 933 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dnajb14Q149L6 379 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dyrk2Q5U4C9 599 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DbhQ64237 622 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bend5Q8C6D4 421 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MydgfQ9CPT4 166 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Retreg3Q9CQV4 466 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hddc3Q9D114 179 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q9D9D9 101 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ampd2Q9DBT5 798 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Syvn1Q9DBY1 612 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dmap1Q9JI44 468 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slamf1Q9QUM4 343 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trpc7Q9WVC5 862 aa22.73■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Shroom3Q9QXN0 1986 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arfip1G5E8V9 373 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd151O35566 253 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lzts1P60853 599 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf865Q3U3I9 1058 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GpamQ61586 827 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kank2Q8BX02 843 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nmur2Q8BZ39 395 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npffr2Q924H0 417 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oser1Q9D722 291 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oxct2bQ9ESL0 520 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oxct2aQ9JJN4 520 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adam17Q9Z0F8 827 aa22.72■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r2A2AMT6 306 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ssxb8B1AY40 170 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 OmdO35103 423 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fscn2Q32M02 492 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1128Q7TR47 311 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr20Q7TRX9 314 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rin2Q9D684 903 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.8 ms