RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prorsd1Q9D820 169 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a5Q9D856 535 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il17rbQ9JIP3 499 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GabrqQ9JLF1 638 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IkbkeQ9R0T8 717 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 M1apQ9Z0E1 529 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ern2Q9Z2E3 911 aa12.77□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup205A0A0J9YUD5 2061 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C7D3YXF5 845 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pknox1O70477 436 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adcy1O88444 1118 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChgbP16014 677 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Flt3lgP49772 232 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abce1P61222 599 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WasP70315 520 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Entpd7Q3TCT4 606 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Proser1Q5PRE5 913 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr19Q61121 415 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fstl1Q62356 306 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DbhQ64237 622 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprjQ64455 1238 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp2a3Q64518 1038 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rapgefl1Q68EF8 662 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mon1aQ6PDG8 556 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zpbp2Q6X786 326 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr792Q7TRH9 311 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kirrel2Q7TSU7 700 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam181bQ80VF6 417 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ticam2Q8BJQ4 232 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kansl2Q8BQR4 486 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spdye4bQ8CDE8 236 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep57Q8CEE0 500 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mark4Q8CIP4 752 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dedd2Q8QZV0 330 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgpl1Q8R0X7 568 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsmce2Q91VT1 247 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fads1Q920L1 447 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krcc1Q99JT5 256 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam136aQ9CR98 138 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LrgukQ9D5S7 820 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NckipsdQ9ESJ4 714 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neu2Q9JMH3 379 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angptl2Q9R045 493 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem115Q9WUH1 350 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ApipQ9WVQ5 241 aa12.77□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TriobpQ99KW3 2014 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc1a6O35544 561 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aff3P51827 1254 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClgnP52194 611 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkcgP63318 697 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc61Q3UJV1 511 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upf3aQ3ULJ3 422 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il17aQ62386 158 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r115Q7M719 310 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naaladl1Q7M758 745 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Catsper3Q80W99 395 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crb2Q80YA8 1282 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a7Q8BLV3 726 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl38Q8BSF5 581 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap25Q8BYW1 648 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mul1Q8VCM5 352 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BsndQ8VIM4 307 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glra3Q91XP5 464 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ProzQ9CQW3 399 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ing2Q9ESK4 281 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Padi3Q9Z184 664 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armt1A6H630 439 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310061I04RikB8JJ69 315 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrna4O70174 629 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr5P61965 334 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myadml2Q08AU7 307 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdpoz3Q717B4 365 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb13Q80Y75 316 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc36a3Q811P0 477 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gjc2Q8BQU6 440 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc151Q8BSN3 593 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ophn1Q99J31 802 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Def8Q99J78 448 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GatbQ99JT1 557 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl2Q9D0J4 184 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Borcs5Q9D920 195 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slfn2Q9Z0I6 378 aa12.76□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930558K02RikE0CXC6 182 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl18E9PYR1 771 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms