RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM38O00635 465 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 BRINP1O60477 761 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCHQ86VS3 1027 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CHSY1Q86X52 802 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 OXR1Q8N573 874 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CA5BQ9Y2D0 317 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SDC4P31431 198 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FLT3P36888 993 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf54Q08AI8 447 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP1B1Q16678 543 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC14Q49A88 953 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 BOLA3Q53S33 107 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM69Q86WT6 500 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A45Q8N413 288 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC1Q8N766 993 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCBQ99426 244 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM51Q9NW97 253 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A4O43246 635 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SDC3O75056 442 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 IRAK1P51617 712 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R38P59533 333 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TLE3Q04726 772 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN1Q12860 1018 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A1Q13621 1099 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD3Q15059 726 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 VSIG1Q86XK7 387 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF11Q92914 225 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5C3BQ969T7 300 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RRN3Q9NYV6 651 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 DMTF1Q9Y222 760 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC6O43699 453 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP9BO43861 1147 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ENDOD1O94919 500 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMD1P0DJR0 217 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GLDCP23378 1020 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 OVGP1Q12889 678 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF5Q15542 800 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TAZQ16635 292 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRNP1Q6NT89 227 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 STRADAQ7RTN6 431 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF843Q8N446 348 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKT4Q8WW24 435 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP8O43159 456 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 DAB1O75553 588 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 APOEP02649 317 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MIPP30301 263 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 NOS2P35228 1153 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA3P32297 505 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT1P36639 197 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT2A1Q06520 285 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.51■■□□□ 1.51
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