RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621161.4

RAB11FIP4-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 8,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STK40Q8N2I9 435 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PNPLA3Q9NST1 481 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OR2AT4A6NND4 320 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PLK4O00444 970 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MID1O15344 667 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EPHB3P54753 998 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ILDR2Q71H61 639 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RRM1P23921 792 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 WEE1P30291 646 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DSELQ8IZU8 1212 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NOTOA8MTQ0 251 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NR2C2P49116 596 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ALG10Q5BKT4 473 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UBXN11Q5T124 520 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UNC5CLQ8IV45 518 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ANKFN1Q8N957 763 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KCNA5P22460 613 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ITIH5Q86UX2 942 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LY9Q9HBG7 655 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SPAG4Q9NPE6 437 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MKLN1Q9UL63 735 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MUSKO15146 869 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HMGCRP04035 888 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ITGB3P05106 788 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SNX20Q7Z614 316 aa20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LCN1P1Q5VSP4 162 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ITFG2Q969R8 447 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC28A1O00337 649 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PROCP04070 461 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ABL2P42684 1182 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RDH8Q9NYR8 311 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FBXO21O94952 628 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTSEP14091 401 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SPP2Q13103 211 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SETD6Q8TBK2 473 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MGME1Q9BQP7 344 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STARD7Q9NQZ5 370 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GSTT2BP0CG30 244 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NR1I3Q14994 352 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GPR107Q5VW38 600 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RTL4Q6ZR62 310 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DNASE1L1P49184 302 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 E2F2Q14209 437 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CHST4Q8NCG5 386 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RAD51AP1Q96B01 352 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ARL15Q9NXU5 204 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TDP2O95551 362 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GRAPQ13588 217 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PI4K2AQ9BTU6 479 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBCCD1Q9NVR7 557 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AASSQ9UDR5 926 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CUL2Q13617 745 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DCLK1O15075 740 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AVILO75366 819 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF3P17036 446 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SCGB2A2Q13296 93 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GNG13Q9P2W3 67 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PHF24Q9UPV7 400 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OPLAHO14841 1288 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC58Q4VC31 144 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EFCAB12Q6NXP0 572 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LHFPL3Q86UP9 236 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PP2D1A8MPX8 630 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 F5H6K3 240 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BTN3A1O00481 513 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OGTO15294 1046 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AXLP30530 894 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KLRC3Q07444 240 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 L7N2F9 121 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 S100PP25815 95 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MARSP56192 900 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 VAMP2P63027 116 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPP3R1P63098 170 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 JAZF1Q86VZ6 243 aa19.98■□□□□ 0.79
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RNF148Q8N7C7 305 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms