RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF534Q76KX8 674 aa21.85■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 TERB1Q8NA31 727 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 USP33Q8TEY7 942 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 COX16Q9P0S2 106 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 MFSD11O43934 449 aa21.84■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 FYB2Q5VWT5 728 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 RFX8Q6ZV50 586 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 SYT13Q7L8C5 426 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA21Q7Z572 469 aa21.84■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.84■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.84■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.83■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 AZIN2Q96A70 460 aa21.83■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.83■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.83■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 K7ESF4 209 aa21.82■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.82■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.82■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.82■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC2A3P11169 496 aa21.81■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 NELL1Q92832 810 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP36Q96G28 342 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 P2RY11Q96G91 374 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 LGMNQ99538 433 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO10Q9UK96 956 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.81■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 GFRA3O60609 400 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 TDGF1P13385 188 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 CCR1P32246 355 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 SCTRP47872 440 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 DMWDQ09019 674 aa21.8■■□□□ 1.08
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