RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617719.4

ATXN3-251, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-251ENST00000617719 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 USP49Q70CQ1 688 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 TEX19Q8NA77 164 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 HVCN1Q96D96 273 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 ACAP3Q96P50 834 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.75□□□□□ -1.65
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ATXN3-251ENST00000617719 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CDH22Q9UJ99 828 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 TMCO1Q9UM00 188 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 TBX20Q9UMR3 447 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 MTMR6Q9Y217 621 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
ATXN3-251ENST00000617719 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 VWA8A3KMH1 1905 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 A0A0B4J269 797 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 ANHXE9PGG2 379 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 M0R296 226 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 CLDN3O15551 220 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 ADAM12O43184 909 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-251ENST00000617719 DAPK3O43293 454 aa4.74□□□□□ -1.65
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