RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf38Q5JPI3 329 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC73Q5JTD7 316 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PHACTR4Q8IZ21 702 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KCNE4Q8WWG9 221 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 DPH1Q9BZG8 443 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TM7SF2O76062 418 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KRT3P12035 628 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 UNGP13051 313 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RPIAP49247 311 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RAD51Q06609 339 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf61Q13536 156 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PERM1Q5SV97 790 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35F3Q8IY50 421 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 GLMNQ92990 594 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SLC46A1Q96NT5 459 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC61Q9BV99 259 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TOR1BO14657 336 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 MUSKO15146 869 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KLK10O43240 276 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TCEA3O75764 348 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TIMP2P16035 220 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ITIH2P19823 946 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CRTC1Q6UUV9 634 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 MACC1Q6ZN28 852 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SLC13A1Q9BZW2 595 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CLPBQ9H078 707 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 VPS16Q9H269 839 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 DKK3Q9UBP4 350 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.23■■□□□ 1.63
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PTPRF-216ENST00000617451 EPHB6O15197 1021 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 YY2O15391 372 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 IGSF6O95976 241 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ANXA6P08133 673 aa25.22■■□□□ 1.63
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PTPRF-216ENST00000617451 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RHDQ02161 417 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CFHR1Q03591 330 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 FAXCQ5TGI0 409 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 WDR59Q6PJI9 974 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PYROXD2Q8N2H3 581 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NETO2Q8NC67 525 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NAT6Q93015 286 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 WBP1Q96G27 269 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 EPAS1Q99814 870 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KLC2Q9H0B6 622 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TSHRP16473 764 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 GPD1P21695 349 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 EPHB2P29323 1055 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RHOAP61586 193 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SKOR1P84550 965 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF605Q86T29 641 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 WDR48Q8TAF3 677 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CASC3O15234 703 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G2AP14555 144 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SUOXP51687 545 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PPARDQ03181 441 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 KRT31Q15323 416 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.2■■□□□ 1.62
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